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人体微生物三代宏基因组测序


    宏基因组学(Metagenomics),是以特定生境中的整个微生物群落作为研究对象,采用新一代高通量测序技术,获得环境微生物基因信息总和,研究环境微生物的群落结构、物种分类、系统进化、基因功能及代谢网络等。宏基因组测序摆脱了传统研究中微生物分离培养的技术限制,直接提取环境样本DNA 进行测序,具有通量高、速度快、信息全等特点,在鉴定低丰度的微生物群落、挖掘更多基因资源方面具有很大优势,基于测序技术和生物信息学的快速发展,宏基因组技术优势在微生物研究领域中愈发明显,应用范围愈发广泛。


    目前,大部分宏基因组研究中使用了二代测序技术,其较低的成本可以满足大多数科研工作者的要求。然而,二代测序读长短的劣势在面对复杂微生物群落时显得十分明显。PacBio SMRT测序的长读长可以减少部分拼接错误,有效提高微生物群落鉴定的分辨率。



  • 特殊生境中微生物菌群研究 Study on microbial flora of special environment


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