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常见问题


Q1:BSA分析项目需要哪些材料信息?

    需要纯合亲本和分离群体材料(F2RIL,通常林木或鱼类可选用F1);分离群体性状为质量性状或主效基因控制的数量性状;分离群体极端性状需鉴定准确;建议全基因组重测序:2个亲本需要>25x测序,分离群体的数量及测序数据量足够(子代>20个,每个子代混池>25x),不建议采用简化基因组。


Q2: 构建遗传图谱需要哪些材料信息?

    需要纯合亲本和分离群体材料(F2RILBCDH等,通常林木或鱼类可选用F1);分离群体性状为质量性状或主效基因控制的数量性状;分离群体随机取样;全基因组重测序: 2个亲本各需要>20x测序,分离群体的数量及测序数据量足够(子代>150个,每个样本>5x);简化基因组建议:有参考基因组(2个亲本各5-10x,子代>150个,每个样本>1x);表型鉴定部位和环境保持一致,表型记录要准确。


Q3: 遗传进化分析项目需要哪些材料信息?

    动植物自然群体;每个亚群间划分明显,同一亚群内的个体有一定代表性(如野生种与驯化种、地理亚群等);建议至少三个亚群,每个亚群选取至少10个样本(如植物≥15个, 动物≥10个,珍稀物种可适当减少个体);简化基因组测序:有参考基因组(每个样本1x 以上),无参考基因组(每个样本5x以上)。


Q4: 全基因组关联分析项目需要哪些材料信息?

    动植物自然群体;样本具有代表性且不能有明显的亚群分化;质量性状样本数尽可能接近,数量性状尽可能精确量化记录且表型总体趋于正态分布;样本量至少200个;全基因组测序:基于SNP/Indel分析,建议10x以上,基于CNV/SV分析,建议30x以上,不建议采用简化基因组;表型鉴定部位和环境保持一致,表型记录要准确。


Q5: GWAS在性状定位中有哪些优势?

    与传统定位相比,GWAS研究具有定位精度高,无需构建作图群体,一次考察多个性状等优势,一般可以直接获得与目标性状相关的标记。



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